二氧化碳
二氧化碳是沼气中只次于的主要成分。不同类型的底物在发酵产沼气过程中都会产生二氧化碳。底物转化生成沼气是一个复杂的过程，涉及多个阶段和不同类型的微生物菌样，二氧化碳可形成于不同的阶段。在产阶段，二氧化碳作为电子受体，也可被转化成。
二氧化碳会减低沼气热值，如果需要增加沼气热值(如用作车用燃气或并入管网)，应分离除去二氧化碳。沼气作为其他用途，例如，沼气发电或集中供气，沼气含有二氧化碳不会有大的问题，但是，二氧化碳溶于冷凝水形成碳酸，对管道和沼气脱硫设备有预定的腐蚀。
1、沼气工程配套设备坚持资源化原则
资源化利用是农业废弃物污染防治的核心内容。农业废弃物是一种有价值的资源，经过处理后可作为燃料、肥料、饲料、工业原料等，具有很大的经济价值。利用好农业废弃物资源，不仅可减轻对环境的污染，还可改良土壤理化性状，提高土壤肥力，提高农产品产量和品质，增加产品竞争力。
2、沼气工程配套设备坚持减量化原则
鉴于畜禽养殖场污染排放量大的特点，在污染防治上应强调减量化原则，即通过生产结构调整及开展清洁生产减少污染物产生量，从而降低处理难度及处理成本，同时也可使农业废弃物的肥效得以保存和处理利用。
沼气工程设备故障排除方法
沼气池原料：
沼气池启动时，初次加入堆沤发酵的原料，原料液面上不产生串珠状气泡， 或者液面上出现一层白色膜状物，类似于酸菜容器中的膜状物，表明原料是消毒粪或者原料中的酸性过强。
排除方法：抽出全部原料，用合格牛粪进行堆沤发酵重新启动，或者将原料抽出1~2米3,从正常使用的沼气池中抽取等量沼渣加入，使沼液酸碱度趋于正常值，逐渐产生沼气。